Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms