Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgn5Q9JL35 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgn5Q9JL35 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms