Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms