Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms