Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Uchl3Q9JKB1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Uchl3Q9JKB1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Uchl3Q9JKB1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Uchl3Q9JKB1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms