Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tuba8Q9JJZ2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tuba8Q9JJZ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tuba8Q9JJZ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tuba8Q9JJZ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tuba8Q9JJZ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tuba8Q9JJZ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tuba8Q9JJZ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tuba8Q9JJZ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tuba8Q9JJZ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tuba8Q9JJZ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tuba8Q9JJZ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms