Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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