Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Riox1Q9JJF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Riox1Q9JJF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms