Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms