Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms