Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus3Q9JI38 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms