Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk3Q9ERH7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms