Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr61Q9ERF3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr61Q9ERF3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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