Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tlr1Q9EPQ1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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