Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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