Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc89Q9DA73 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms