Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms