Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cntd1Q9D995 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntd1Q9D995 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms