Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hm13Q9D8V0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hm13Q9D8V0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hm13Q9D8V0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hm13Q9D8V0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hm13Q9D8V0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hm13Q9D8V0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hm13Q9D8V0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hm13Q9D8V0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms