Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snx5Q9D8U8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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