Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn9Q9D805 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn9Q9D805 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms