Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms