Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms