Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms