Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q9D4W2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q9D4W2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms