Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms