Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms