Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2G5

Synj2, Synaptojanin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj2Q9D2G5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synj2Q9D2G5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synj2Q9D2G5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synj2Q9D2G5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synj2Q9D2G5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synj2Q9D2G5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Synj2Q9D2G5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms