Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms