Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ndc80Q9D0F1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ndc80Q9D0F1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ndc80Q9D0F1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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