Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms