Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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