Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms