Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CWU4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms