Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms