Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms