Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PclafQ9CQX4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PclafQ9CQX4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms