Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ykt6Q9CQW1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ykt6Q9CQW1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ykt6Q9CQW1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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