Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms