Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab5aQ9CQD1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms