Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CPS8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CPS8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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