Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms