Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms