Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms