Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gdpd3Q99LY2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms