Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmo1Q924W9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms