Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms