Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1bQ91YK2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms