Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul7Q8VE73 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul7Q8VE73 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms