Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hip1Q8VD75 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms